Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA1P25391 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms