Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB8P17481 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms