Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms