Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHAP12694 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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