Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJB1P08034 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJB1P08034 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJB1P08034 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB1P08034 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms