Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms