Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms