Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms