Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms