Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms