Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUX2O14529 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CUX2O14529 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUX2O14529 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUX2O14529 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUX2O14529 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUX2O14529 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUX2O14529 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUX2O14529 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUX2O14529 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CUX2O14529 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CUX2O14529 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CUX2O14529 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUX2O14529 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CUX2O14529 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUX2O14529 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUX2O14529 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUX2O14529 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUX2O14529 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CUX2O14529 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUX2O14529 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUX2O14529 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUX2O14529 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUX2O14529 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUX2O14529 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUX2O14529 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms