Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms