Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms