Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms