Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms