Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRR3A8MPY1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms