Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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C4orf47A7E2U8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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C4orf47A7E2U8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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C4orf47A7E2U8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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C4orf47A7E2U8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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C4orf47A7E2U8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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C4orf47A7E2U8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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C4orf47A7E2U8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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C4orf47A7E2U8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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C4orf47A7E2U8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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C4orf47A7E2U8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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C4orf47A7E2U8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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C4orf47A7E2U8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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