Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NL46 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A6NL46 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A6NL46 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A6NL46 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NL46 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NL46 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms