Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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