Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms