Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP1Q9Y3L3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SH3BP1Q9Y3L3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SH3BP1Q9Y3L3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SH3BP1Q9Y3L3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SH3BP1Q9Y3L3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SH3BP1Q9Y3L3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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SH3BP1Q9Y3L3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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SH3BP1Q9Y3L3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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