Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CAB39Q9Y376 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CAB39Q9Y376 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CAB39Q9Y376 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CAB39Q9Y376 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CAB39Q9Y376 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAB39Q9Y376 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CAB39Q9Y376 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CAB39Q9Y376 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAB39Q9Y376 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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