Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS11EQ9UL52 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms