Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms