Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPC1L1Q9UHC9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms