Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms