Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms