Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms