Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms