Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMPRSS4Q9NRS4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms