Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms