Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms