Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms