Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms