Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms