Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms