Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SEC22CQ9BRL7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SEC22CQ9BRL7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SEC22CQ9BRL7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SEC22CQ9BRL7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SEC22CQ9BRL7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SEC22CQ9BRL7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SEC22CQ9BRL7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SEC22CQ9BRL7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SEC22CQ9BRL7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SEC22CQ9BRL7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEC22CQ9BRL7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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