Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms