Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC9Q96Q05 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms