Protein–RNA interactions for Protein: Q96PI1

SPRR4, Small proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR4Q96PI1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR4Q96PI1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms