Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms