Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms