Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms