Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCG3Q8WXD2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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