Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
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TTC21AQ8NDW8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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TTC21AQ8NDW8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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