Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RASGEF1AQ8N9B8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RASGEF1AQ8N9B8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RASGEF1AQ8N9B8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RASGEF1AQ8N9B8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RASGEF1AQ8N9B8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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