Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLNKQ7Z7G1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLNKQ7Z7G1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms