Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms