Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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USP53Q70EK8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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USP53Q70EK8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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USP53Q70EK8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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USP53Q70EK8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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USP53Q70EK8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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