Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms